@yo.yo
このような予実のデータ構造であれば、一般的にはUNION（縦結合）になりますね。ただ、ご認識通り、QuickSightのデータ準備では現時点ではサポートされていません。お客様からの要望も多いため、今後サポートしていく可能性もあり、Featureリクエストとしてタグ付けさせていただきます。
JOINで実現する場合は、データの利用要件を明確にして実現可能かどうかをみていく必要があると思います。お役に立てずに申し訳ありません。
今回QuickSightにアップロードする前に結合する作業は考慮しない、とご教示いただいていますが、来週Learning SeriesでGlueを使用したデータ準備について、ウェビナーを開催します。一応。ご参考までに。